Läkaren, skeptikern och FBI-agenten Dana Scully får i uppdrag att tjäna som vetenskaplig motvikt till den kollega som har tagit på sig att arbeta med FBI:s så kallade X-akter, det vill säga de fall som inte har kunnat lösas med normala medel, så att hans arbete kan styras åt rätt håll. Men när Scully möter den passionerade, påläste och lite underlige Fox Mulder, och allt konstigare fall kommer i deras väg får hon svårt att hålla sig objektiv. Hon bestämmer sig för att ansluta sig till samma avdelning, men upptäcker snart att Mulders misstankar om en konspiration inom FBI - och kanske på högre ort - stämmer.

Serien, som skapades av Chris Carter, handlar om de två FBI-agenterna Dana Scully och Fox Mulder som arbetar på FBI:s avdelning för paranormala fenomen. Framgången både hos publik och kritiker kom redan under första säsongen, och berodde enligt många på skådespelarna David Duchovny och Gillian Anderson.

Avsnittens idéer och stil liknade de tidigare succéerna The Outer Limits, Twilight Zone och Twin Peaks, om än ofta med en speciell verbal humor som de serierna saknade. Andra inspirationskällor var den tecknade serien Men in black, som senare blev film,[5] och olika dagsaktuella händelser.